心脏外科专业被北京市卫生局认定为北京小儿先心病诊治中心，以小年龄、低体重，复杂畸形为专长，已成功开展各种先心病的外科治疗，包括大动脉调转手术、肺动脉闭锁矫治术、右心室双出口矫治术、主动脉弓中断矫治术、完全肺静脉畸形引流矫治术，完全心内膜垫缺损矫治术，法洛氏四联症矫治术、各型血管环矫治手术、冠状动脉起源异常矫治术，以及复杂先心病的姑息手术如Fontan手术、体肺分流术、腔肺分流术、单源化手术等;目前常见先心病手术成功率>98%，复杂先心病手术成功率>90%，1岁以内新生儿及婴儿占收治病人总数65%以上，最小ECMO辅助成功病例，体重为3.4公斤，最低体重患儿仅为700克，达到国内领先水平。同时病房内还开展了心外导管室介入治疗常见先心病，如房间隔缺损、室间隔缺损、动脉导管未闭，肺动脉瓣狭窄、血管瘤、肺内动静脉瘘等，每年达300余例。心脏外科有10张心脏术后监护床，护理团队在儿童心外科及血管外科的危重症识别及护理方面具有高超的专业技能和丰富的临床经验；作为北京护理学会心血管专科护士临床实践基地，目前已经培养多名心血管专科护士；为满足先心病患儿的远程护理需求，心脏外科护理团队开设了先心病患儿互联网护理门诊，于每周四下午为患儿解答各种护理问题。“把爱带回家”是心脏外科全体医护的共同愿景，希望通过医护团队的共同努力，为患儿提供最佳的医疗护理服务。